中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所从事农产品质量安全科学研究和技术创新，以食用农产品及饲料为研究对象，开展农兽药和重金属等有毒有害物质残留动态、农产品质量安全溯源及真假识别等检测技术研究；开展农产品质量安全风险分析理论和关键技术、农产品种养殖过程质量安全控制技术等研究、农产品贸易技术壁垒预警体系建设及快速反应机制；开展国内外农产品质量安全标准研究与制修订；承担国家农产品及饲料质量安全风险监测、监督抽查等监控技术支持。

同时，研究所作为国家级农产品质量安全风险评估机构，在农产品质量安全例行监测、专项监测、风险监测、风险评估体系建设、饲料及畜产品质量安全监测、官方通报评议和舆情监测等方面开展了大量卓有成效的支撑服务工作，为农业部实现“两个努力确保”的总体目标做出了贡献。尤其是在建国60周年食品安全保障、“助奥行动”等重大活动和“三聚氰胺”、“瘦肉精”、“孔雀石绿”、“苏丹红”等违禁添加物突发事件查处和拉网检测中，发挥了巨大的作用，先后多次受到农业部和公安部的表彰， 荣获农业部“助奥行动”先进集体称号。

        2020年10月13日，中国农科院质标所与云顶国际企业管理（中国）有限公司（以下简称：云顶国际）共建的农产品质量安全战略合作中心举行了揭牌仪式，同时进行了相关的学术报告交流及探讨。双方致力于推动现代科学分析仪器在农业生产及农产品中的应用，以及相关标准的修订和分析方法的开发，在农产品质量安全等相关研究中开展深入、全面的合作，希望用出色的研究成果，为中国食品农产品安全贡献力量。

        中国农科院质标所使用云顶国际多款仪器进行农业领域的相关研究工作，包括在线凝胶色谱串联三重四极杆气质联用仪GPC-GC-MS/MS、全二维气相色谱- 三重四极杆质谱联用仪GCⅹGC-qMS、超临界流体萃取- 超临界流体色谱- 三重四极杆液质联用仪SFE-SFC-MS、三重四极杆液质联用仪LCMS-8050 等。